Генетический код и биосинтез белка

ДНК → иРНК → белок, число кодонов и тРНК, масса белка и таблица генетического кода

От режима зависят поля ниже

Для матричной цепи иРНК строится комплементарно

Буквы A, T, G, C для ДНК или A, U, G, C для иРНК; матричная цепь — 3′→5′, смысловая и иРНК — 5′→3′

Должно делиться на 3

Тогда одна аминокислота не синтезируется

Три нуклеотида: AUG, ATG, UAA

Как заполнять по формуле: матричную цепь ДНК записывайте в направлении 3′→5′, смысловую цепь и иРНК — 5′→3′; пробелы не важны.

Пример матричной цепи (3′→5′): TACGGATTTCAAATT → иРНК AUGCCUAAAGUUUAA → белок M–P–K–V, стоп UAA. Для иРНК замените T на U.

Число нуклеотидов должно делиться на 3: 300 → 100 кодонов → 100 аминокислот и 100 тРНК.

Один кодон из трёх букв: AUG, ATG или UAA. Полная таблица кодонов — в теории ниже.

Нашли ошибку или хотите предложить улучшение?

Улучшить калькулятор «Генетический код и биосинтез белка»

Теория

Ген хранит информацию в последовательности нуклеотидов ДНК. При транскрипции с матричной цепи ДНК строится иРНК, а при трансляции рибосома читает её тройками — кодонами. Матричную цепь записывают в направлении 3′→5′, а иРНК — 5′→3′. Каждый кодон соответствует одной аминокислоте, поэтому число кодонов и аминокислот в безынтронном гене связано с числом нуклеотидов: \( n_{\text{кодонов}} = n_{\text{нуклеотидов}} / 3 \).

Генетический код вырожден: большинство аминокислот кодируются несколькими кодонами, но один кодон всегда означает одну и ту же аминокислоту. Синтез белка начинается с кодона AUG — старт-кодона, который кодирует метионин. Три кодона — UAA, UAG и UGA — стоп-кодоны: аминокислоту они не кодируют, а завершают синтез белка. тРНК приносит аминокислоту к кодону; её антикодон комплементарен кодону иРНК.

Важно: стоп-кодон не входит в число аминокислот; средняя масса аминокислотного остатка принимается равной 110 Да.

Пример с решением

  1. Условие. Дана матричная цепь ДНК (3′→5′) TACGGATTTCAAATT. Построить иРНК и белок.
  2. Формула. иРНК строится комплементарно с заменой T на U: A → U, T → A, G → C, C → G.
  3. Подстановка. иРНК: AUGCCUAAAGUUUAA; кодоны: AUG, CCU, AAA, GUU, UAA.
  4. Вычисление. AUG — старт-кодон и метионин, CCU — пролин, AAA — лизин, GUU — валин; UAA — стоп. Аминокислот 4, масса \( 4 \cdot 110 = 440 \) Да.
  5. Ответ. Белок M–P–K–V (Мет–Про–Лиз–Вал), масса 440 Да; синтез завершает стоп-кодон UAA.

Главное

  • Три нуклеотида: один кодон.
  • Старт: AUG — метионин и старт-кодон.
  • Стоп-кодоны: UAA, UAG, UGA — без аминокислоты.
  • Масса: примерно 110 Да на аминокислотный остаток.

Таблица генетического кода

Кодон Аминокислота Сокращение Буква
UUU Фенилаланин Фен F
UUC Фенилаланин Фен F
UUA Лейцин Лей L
UUG Лейцин Лей L
UCU Серин Сер S
UCC Серин Сер S
UCA Серин Сер S
UCG Серин Сер S
UAU Тирозин Тир Y
UAC Тирозин Тир Y
UAA стоп — —
UAG стоп — —
UGU Цистеин Цис C
UGC Цистеин Цис C
UGA стоп — —
UGG Триптофан Три W
CUU Лейцин Лей L
CUC Лейцин Лей L
CUA Лейцин Лей L
CUG Лейцин Лей L
CCU Пролин Про P
CCC Пролин Про P
CCA Пролин Про P
CCG Пролин Про P
CAU Гистидин Гис H
CAC Гистидин Гис H
CAA Глутамин Глн Q
CAG Глутамин Глн Q
CGU Аргинин Арг R
CGC Аргинин Арг R
CGA Аргинин Арг R
CGG Аргинин Арг R
AUU Изолейцин Иле I
AUC Изолейцин Иле I
AUA Изолейцин Иле I
AUG Метионин Мет M
ACU Треонин Тре T
ACC Треонин Тре T
ACA Треонин Тре T
ACG Треонин Тре T
AAU Аспарагин Асн N
AAC Аспарагин Асн N
AAA Лизин Лиз K
AAG Лизин Лиз K
AGU Серин Сер S
AGC Серин Сер S
AGA Аргинин Арг R
AGG Аргинин Арг R
GUU Валин Вал V
GUC Валин Вал V
GUA Валин Вал V
GUG Валин Вал V
GCU Аланин Ала A
GCC Аланин Ала A
GCA Аланин Ала A
GCG Аланин Ала A
GAU Аспарагиновая кислота Асп D
GAC Аспарагиновая кислота Асп D
GAA Глутаминовая кислота Глу E
GAG Глутаминовая кислота Глу E
GGU Глицин Гли G
GGC Глицин Гли G
GGA Глицин Гли G
GGG Глицин Гли G